19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2850 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  45.61 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  41.38 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  33.65 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  40.74 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  41.43 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  34.29 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  29.52 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  25.47 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  28.24 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  53.85 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  31.82 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  37.1 
 
 		 304 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  29.82 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  69.57 
 
 		 125 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>