21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2417 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  43.65 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  40 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  36.84 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3205  putative nucleic acid-binding protein  38.68 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  28.78 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  25.9 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1354  nucleic acid binding protein  29.2 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  24.8 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  30.6 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  27.59 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  29.85 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  32.31 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  28.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>