64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1437 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 		 147 aa  308  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2569  hypothetical protein  64.86 
 
 		 77 aa  99.4  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  34.78 
 
 		 211 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  52.38 
 
 		 508 aa  82  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1734  hypothetical protein  49.28 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  37.23 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  32.17 
 
 		 214 aa  77.4  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  32.17 
 
 		 599 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  32.21 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  32.21 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  28.36 
 
 		 215 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  31.25 
 
 		 594 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2660  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0741902  normal  0.253089 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  33.33 
 
 		 219 aa  60.1  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  26.53 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  27.92 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  28.29 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  44.07 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  26.45 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  31.4 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  38.46 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  44.9 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  39.73 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  52 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  36.67 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  38.1 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  44.68 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  38.78 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  38.18 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  40.32 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  45.45 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03958  hypothetical protein  31.75 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03997  hypothetical protein  31.75 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3866  protein of unknown function DUF1271  31.75 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5641  hypothetical protein  31.75 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3901  hypothetical protein  31.75 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4594  hypothetical protein  31.75 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4680  hypothetical protein  31.75 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4367  hypothetical protein  31.75 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325608  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  44 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  44 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  42.86 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  43.4 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  39.66 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  41.86 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  41.18 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  36.21 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  38.46 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  31.94 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  31.94 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  31.94 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  31.94 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  32.43 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  31.94 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1019  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40.91 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4241  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4218  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  39.62 
 
 		 68 aa  42  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4132  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.623958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  63.64 
 
 		 515 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2426  zinc finger CDGSH-type domain protein  39.13 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0623545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1411  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  46.88 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0321891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>