35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1093 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  100 
 
 		 650 aa  1325    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  64.9 
 
 		 646 aa  827    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  48.43 
 
 		 689 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  44.31 
 
 		 647 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  47.11 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  47.11 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  34.65 
 
 		 681 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  33.97 
 
 		 830 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  31.54 
 
 		 658 aa  307  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  30.98 
 
 		 660 aa  308  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  33.02 
 
 		 659 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  35.07 
 
 		 673 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  33.19 
 
 		 1204 aa  247  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  26.92 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  26.3 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4145  hypothetical protein  41.25 
 
 		 103 aa  57.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.946953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  25.37 
 
 		 318 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  26 
 
 		 295 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  35.34 
 
 		 509 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  25.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  25.12 
 
 		 295 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  25.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  23.56 
 
 		 295 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  25.12 
 
 		 295 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  24.62 
 
 		 299 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  25.12 
 
 		 295 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  25.12 
 
 		 295 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  25.12 
 
 		 295 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  23.38 
 
 		 296 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  32 
 
 		 500 aa  47.8  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  38.96 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  33.98 
 
 		 496 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1066  hypothetical protein  29.17 
 
 		 460 aa  44.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1062  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  43.33 
 
 		 291 aa  44.7  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000072755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  24.8 
 
 		 364 aa  44.3  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>