More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1006 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  72.38 
 
 		 214 aa  332  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  68.14 
 
 		 229 aa  332  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  65.07 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  66.67 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  59.62 
 
 		 223 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  61.32 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  59.33 
 
 		 223 aa  274  8e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  54.15 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  54.29 
 
 		 217 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  53.81 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 222 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  52.88 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  55.28 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  53.06 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  54.19 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  52.55 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  52.55 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  52.55 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  54.19 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  52.55 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  54.19 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  55.33 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  52.04 
 
 		 214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  49.49 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  52.04 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  52.55 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  52.48 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  49.03 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  50.5 
 
 		 222 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  51.02 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 220 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  52.8 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 220 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  50.73 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  43.78 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  45.41 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  41.76 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  42.31 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  41.99 
 
 		 213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  41.9 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  43.92 
 
 		 209 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  44.32 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  44.69 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  40.62 
 
 		 195 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  43.24 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  43.24 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  41 
 
 		 206 aa  148  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  43.85 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  43.65 
 
 		 185 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  44.85 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  41.84 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  41.76 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  43.39 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  43.48 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  41.11 
 
 		 203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  41.36 
 
 		 218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  41.94 
 
 		 212 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 189 aa  145  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  41.58 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  41.94 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  40.11 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>