40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
659 aa  1338    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  51.36 
 
 
659 aa  689    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  60.92 
 
 
656 aa  778    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  49.69 
 
 
669 aa  626  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  47.94 
 
 
671 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  49.16 
 
 
658 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  46.48 
 
 
674 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  44.39 
 
 
723 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  41.81 
 
 
639 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  40.33 
 
 
653 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  38.69 
 
 
648 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 
678 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  38.29 
 
 
641 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  38.14 
 
 
641 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  38.14 
 
 
641 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  38.94 
 
 
651 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  38.86 
 
 
637 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  37.4 
 
 
650 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  34.71 
 
 
624 aa  319  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  34.34 
 
 
620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  31.22 
 
 
570 aa  166  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  24.94 
 
 
592 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  24.71 
 
 
592 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  24.94 
 
 
592 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  23.29 
 
 
621 aa  105  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  23.81 
 
 
635 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.92 
 
 
754 aa  75.5  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
489 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
306 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
318 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
317 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
298 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
282 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.83 
 
 
322 aa  49.3  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  27.78 
 
 
337 aa  45.8  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
329 aa  45.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
324 aa  44.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>