25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  32.48 
 
 		 538 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  32.74 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  33.01 
 
 		 432 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  31.2 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  30.7 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  28.61 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  35.84 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  40.33 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  38.96 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  40.31 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  37.13 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  30.5 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  35.16 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  38.32 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  30.47 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  33.68 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  38.14 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  32.18 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  40.37 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  32.99 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  25.41 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  32.12 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  35.14 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>