55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3985 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4681  glycosyl transferase, group 1 family protein  96.94 
 
 		 392 aa  753    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4278  glycosyl transferase group 1  96.88 
 
 		 385 aa  744    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4473  glycosyl transferase group 1  96.92 
 
 		 390 aa  753    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4333  glycosyl transferase group 1  97.18 
 
 		 390 aa  754    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3985  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 390 aa  805    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0595818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0109  glycosyl transferase, group 1 family protein  65.54 
 
 		 402 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84899  normal  0.0173656 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1459  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00514335  hitchhiker  0.00279802 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0456  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  hitchhiker  0.00671618 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.79 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  31.35 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3569  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1802  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  24.59 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2082  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  27.42 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02940  polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.41 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  21.02 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 		 352 aa  47  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.44 
 
 		 360 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4034  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 822 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2090  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  27.52 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  24.17 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 375 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  24.87 
 
 		 346 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 346 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>