28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0335 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  82.58 
 
 
272 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  82.93 
 
 
272 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  77.78 
 
 
277 aa  454  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  94.26 
 
 
221 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  63.05 
 
 
260 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  57.94 
 
 
251 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  56.25 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  50.85 
 
 
305 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  52.5 
 
 
323 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  65.16 
 
 
236 aa  300  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  55.86 
 
 
272 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  65.75 
 
 
255 aa  298  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  61.43 
 
 
213 aa  278  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  61.82 
 
 
229 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  57.27 
 
 
223 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  54.05 
 
 
231 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  38.31 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  34.72 
 
 
216 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  25.63 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  26.63 
 
 
241 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  27.18 
 
 
442 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  27.1 
 
 
524 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  25.28 
 
 
476 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  23.28 
 
 
227 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  28.8 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  23.08 
 
 
199 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  18.03 
 
 
459 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.476459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>