28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3696 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  95.33 
 
 		 471 aa  906    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  92.24 
 
 		 464 aa  866    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  949    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  68.35 
 
 		 470 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  64.19 
 
 		 463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  61 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  59.18 
 
 		 483 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  59.71 
 
 		 482 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  59.63 
 
 		 483 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  41.99 
 
 		 511 aa  342  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  41.29 
 
 		 467 aa  336  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  40.43 
 
 		 464 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  39.88 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  38.55 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  37.02 
 
 		 512 aa  293  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  36.61 
 
 		 511 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  29.78 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  27.88 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  29.68 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  28.38 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  28.97 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  30.28 
 
 		 306 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  30.28 
 
 		 306 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  30.28 
 
 		 305 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 895 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  33.93 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  29.75 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  28.18 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>