52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0634 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 364 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  96.7 
 
 		 364 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  85.71 
 
 		 360 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  85.15 
 
 		 360 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  85.15 
 
 		 360 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  85.15 
 
 		 360 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  84.31 
 
 		 360 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  37.57 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  36.63 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  39.83 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  33.52 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  33.52 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  33.52 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  33.24 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  33.8 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  31.49 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  35.44 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  35.44 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  33.33 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.53 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  26.6 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  30.66 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  30.46 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  26.75 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25.57 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  22.69 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  28.19 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  28.43 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  26.87 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  26.03 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  27.89 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  26.34 
 
 		 304 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  29.14 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  25.62 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  22.12 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  27 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  26.27 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  26.27 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  24.4 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.98 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  25.81 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  22.69 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  24.27 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  23.91 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  21.85 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  24.07 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  21.07 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  23.97 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  22.34 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  24.62 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>