25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0898 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  100 
 
 
342 aa  675    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  35.41 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  35.16 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  35.16 
 
 
340 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  35.16 
 
 
340 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  35.16 
 
 
340 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  35.13 
 
 
360 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  35.16 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  34.84 
 
 
360 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  35.21 
 
 
360 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  34.83 
 
 
360 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  32.78 
 
 
364 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  33.62 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  33.04 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  46.47 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  34.78 
 
 
376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  30.11 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  29.53 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  35.75 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  29.55 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.38 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  27.16 
 
 
305 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  28.57 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  28.57 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  26.19 
 
 
389 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>