More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1129 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2744  aspartate kinase  89.71 
 
 
418 aa  732    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3123  aspartate kinase  88.04 
 
 
418 aa  709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00206455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3427  aspartokinase  95.93 
 
 
418 aa  782    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1251  aspartate kinase  88.52 
 
 
418 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000231974  hitchhiker  0.00000000112827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3266  aspartate kinase  88.28 
 
 
418 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00158192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3114  aspartate kinase  88.28 
 
 
418 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000131076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1128  aspartate kinase  98.8 
 
 
418 aa  827    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000633865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1199  aspartate kinase  99.04 
 
 
418 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000597152  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1129  aspartate kinase  100 
 
 
418 aa  839    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203845  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1049  aspartate kinase  57.42 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00683315  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  48.77 
 
 
413 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  48.53 
 
 
412 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  48.53 
 
 
412 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  49.14 
 
 
411 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  50.74 
 
 
412 aa  352  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  48.64 
 
 
410 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  48.64 
 
 
410 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  47.79 
 
 
408 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  48.64 
 
 
411 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  48.4 
 
 
411 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  48.17 
 
 
414 aa  345  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  47.95 
 
 
424 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  48.15 
 
 
411 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  48.15 
 
 
411 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  48.89 
 
 
410 aa  342  9e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  47.43 
 
 
409 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  47.68 
 
 
413 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  47.33 
 
 
408 aa  336  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  50 
 
 
409 aa  335  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  48.4 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  43.91 
 
 
428 aa  325  7e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  43.68 
 
 
428 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  47.09 
 
 
408 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  46.7 
 
 
413 aa  323  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  44.26 
 
 
427 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  47.42 
 
 
408 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  47.42 
 
 
408 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  44.47 
 
 
406 aa  315  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  47.54 
 
 
409 aa  315  8e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  47.55 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  46.83 
 
 
409 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  46.57 
 
 
421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  46.53 
 
 
407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  46.67 
 
 
416 aa  309  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  46.32 
 
 
422 aa  308  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  45.5 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  45.61 
 
 
422 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  46.29 
 
 
410 aa  307  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  47.74 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  46.1 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  46.1 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  45.63 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  41.28 
 
 
427 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  44.81 
 
 
422 aa  302  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  46.1 
 
 
422 aa  302  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  43 
 
 
405 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  45.1 
 
 
405 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0991  aspartokinase  45.32 
 
 
409 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000471315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  47.03 
 
 
422 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0862  aspartate kinase  46.06 
 
 
416 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  44.39 
 
 
416 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0976  aspartate kinase  46.3 
 
 
416 aa  299  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0884  aspartate kinase  45.07 
 
 
409 aa  297  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000166262  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0074  aspartate kinase  44.91 
 
 
395 aa  295  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101932  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  41.81 
 
 
411 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  44.15 
 
 
417 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  43.73 
 
 
410 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  44.15 
 
 
416 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  43.91 
 
 
416 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  43.91 
 
 
416 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  43.68 
 
 
416 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  43.68 
 
 
416 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  43.68 
 
 
416 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  43.68 
 
 
416 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  43.68 
 
 
416 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  43.68 
 
 
416 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  43.44 
 
 
416 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  43.4 
 
 
417 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  43.4 
 
 
417 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  43.4 
 
 
417 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  41.56 
 
 
400 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  43.91 
 
 
416 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  43.57 
 
 
417 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  45.45 
 
 
410 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  45.48 
 
 
416 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  45.14 
 
 
409 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  42.26 
 
 
407 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  43.77 
 
 
407 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  45.14 
 
 
409 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  45.39 
 
 
409 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  42.72 
 
 
405 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  41.94 
 
 
409 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  42.61 
 
 
404 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  45.35 
 
 
416 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  44.89 
 
 
410 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  43 
 
 
404 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  45.14 
 
 
409 aa  286  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  42.29 
 
 
404 aa  285  8e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  45.14 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  45.14 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>