23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2422 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  62.07 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1632  hypothetical protein  64.44 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  61.4 
 
 		 220 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  60.1 
 
 		 195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  57.75 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  71.43 
 
 		 154 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  44.6 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  54.25 
 
 		 150 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  60 
 
 		 155 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  54.79 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  54.11 
 
 		 143 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  38.98 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2673  hypothetical protein  30.23 
 
 		 293 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  39.3 
 
 		 1821 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  50.72 
 
 		 108 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  43.28 
 
 		 897 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  34.25 
 
 		 1803 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  23.14 
 
 		 438 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  37 
 
 		 1338 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  31.54 
 
 		 1266 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  28.08 
 
 		 674 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>