20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1463 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  374  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  80.93 
 
 
192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  79.14 
 
 
220 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  79.14 
 
 
246 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  69.83 
 
 
154 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  60.1 
 
 
211 aa  221  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  65.56 
 
 
155 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  61.08 
 
 
143 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  60.48 
 
 
143 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1632  hypothetical protein  53.27 
 
 
201 aa  157  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  60 
 
 
150 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  43.32 
 
 
213 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  34.73 
 
 
143 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  45.59 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0225  hypothetical protein  27.61 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  35.2 
 
 
1803 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  23.68 
 
 
438 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  34 
 
 
1338 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3603  hypothetical protein  24.44 
 
 
619 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  31.15 
 
 
1266 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>