21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2457 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  283  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  69.83 
 
 
195 aa  223  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  66.29 
 
 
192 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  71.43 
 
 
211 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  69.48 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  59.78 
 
 
220 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  58.66 
 
 
246 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  67.59 
 
 
143 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  66.21 
 
 
143 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1632  hypothetical protein  73.68 
 
 
201 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  60 
 
 
150 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  43.93 
 
 
213 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  39.16 
 
 
143 aa  141  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  46.88 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2673  hypothetical protein  32.47 
 
 
293 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0225  hypothetical protein  28.79 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  40.51 
 
 
1803 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  25.41 
 
 
438 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  34.31 
 
 
1338 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07261  hypothetical protein  30.68 
 
 
243 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  30.91 
 
 
1266 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>