19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1632 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1632  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  64.44 
 
 		 211 aa  225  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  53.27 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  53.46 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  73.68 
 
 		 154 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  49.38 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  48.13 
 
 		 192 aa  151  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  56.29 
 
 		 150 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  67.2 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  66.06 
 
 		 143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  65.14 
 
 		 143 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  36.89 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3198  hypothetical protein  33.63 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3197  hypothetical protein  23.49 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4940  FtsK/SpoIIIE family protein  28.46 
 
 		 1311 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4585  FtsK/SpoIIIE family protein  28.46 
 
 		 1311 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3713  hypothetical protein  32.11 
 
 		 262 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.464857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  21.97 
 
 		 1266 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  27.78 
 
 		 329 aa  41.6  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>