17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2775 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  294  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  61.65 
 
 
220 aa  218  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  72.46 
 
 
246 aa  216  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  70.48 
 
 
192 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  65.56 
 
 
195 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  69.03 
 
 
143 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  67.1 
 
 
143 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  69.48 
 
 
154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  60 
 
 
211 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1632  hypothetical protein  67.2 
 
 
201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  46.79 
 
 
213 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  48.08 
 
 
150 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2673  hypothetical protein  38.22 
 
 
293 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  38.1 
 
 
1088 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  43.75 
 
 
1803 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>