16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1601 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  44.6 
 
 
211 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  43.81 
 
 
246 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  46.12 
 
 
220 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  43.32 
 
 
195 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  44.27 
 
 
192 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  43.93 
 
 
154 aa  141  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  32.3 
 
 
143 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  46.79 
 
 
155 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  42 
 
 
150 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  41.89 
 
 
143 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  41.22 
 
 
143 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  48.48 
 
 
108 aa  85.1  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  20.34 
 
 
438 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  28.08 
 
 
674 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07261  hypothetical protein  31.82 
 
 
243 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>