18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1410 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  95.45 
 
 		 220 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  78.65 
 
 		 192 aa  278  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  79.14 
 
 		 195 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  62.07 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  72.46 
 
 		 155 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  58.66 
 
 		 154 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  63.64 
 
 		 143 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  62.99 
 
 		 143 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  43.81 
 
 		 213 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1632  hypothetical protein  49.38 
 
 		 201 aa  155  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2673  hypothetical protein  36.82 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  35.33 
 
 		 143 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  48.51 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  35.88 
 
 		 1088 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  33.94 
 
 		 108 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  37.42 
 
 		 1803 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  19.34 
 
 		 438 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>