20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3085 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  363  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  80.93 
 
 		 195 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  78.65 
 
 		 220 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  78.65 
 
 		 246 aa  278  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  57.75 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  66.29 
 
 		 154 aa  214  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  72.55 
 
 		 143 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  70.48 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  71.9 
 
 		 143 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1632  hypothetical protein  48.13 
 
 		 201 aa  151  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  44.27 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  45.7 
 
 		 150 aa  131  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  34.34 
 
 		 143 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  44.93 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0225  hypothetical protein  29.63 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  35.34 
 
 		 1803 aa  55.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3941  hypothetical protein  18.65 
 
 		 327 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  23.33 
 
 		 438 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3603  hypothetical protein  24.29 
 
 		 619 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  34 
 
 		 1338 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>