17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2165 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  272  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2673  hypothetical protein  53.12 
 
 		 293 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  39.16 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  43.33 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  38.98 
 
 		 211 aa  135  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  32.3 
 
 		 213 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  34.73 
 
 		 195 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  35.33 
 
 		 246 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  35.33 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  34.34 
 
 		 192 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  35.81 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  34.27 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  46.23 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  23.01 
 
 		 438 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07261  hypothetical protein  19.57 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  19.63 
 
 		 674 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>