21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3023 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3023  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  285  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  54.25 
 
 
211 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2457  hypothetical protein  60 
 
 
154 aa  154  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1632  hypothetical protein  56.29 
 
 
201 aa  150  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1463  hypothetical protein  60 
 
 
195 aa  144  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2165  hypothetical protein  43.33 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.324549  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3085  hypothetical protein  45.7 
 
 
192 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2775  hypothetical protein  48.08 
 
 
155 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2758  hypothetical protein  53.77 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1475  hypothetical protein  49.25 
 
 
220 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.658618  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1410  hypothetical protein  48.51 
 
 
246 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2852  hypothetical protein  52.73 
 
 
143 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1601  hypothetical protein  42 
 
 
213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132494  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2673  hypothetical protein  38.4 
 
 
293 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2594  hypothetical protein  53.62 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  37.5 
 
 
1338 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  34.04 
 
 
1803 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4940  FtsK/SpoIIIE family protein  41.75 
 
 
1311 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4585  FtsK/SpoIIIE family protein  41.75 
 
 
1311 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  34.95 
 
 
1266 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4440  cell division protein  36.14 
 
 
1266 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>