More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0774 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  50.87 
 
 
741 aa  808    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  53.87 
 
 
752 aa  854    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  77.17 
 
 
766 aa  1212    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  76.35 
 
 
763 aa  1218    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  76.73 
 
 
765 aa  1241    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  77.12 
 
 
771 aa  1205    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  73.02 
 
 
775 aa  1115    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  77.25 
 
 
771 aa  1212    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  48.07 
 
 
729 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  51.8 
 
 
735 aa  800    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  76.67 
 
 
748 aa  1215    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  76.45 
 
 
763 aa  1219    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  77.67 
 
 
767 aa  1210    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  76.58 
 
 
763 aa  1221    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  72.62 
 
 
767 aa  1170    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  76.69 
 
 
768 aa  1243    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  77.31 
 
 
760 aa  1219    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  76.71 
 
 
763 aa  1226    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  70.93 
 
 
768 aa  1128    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  100 
 
 
750 aa  1549    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  47.93 
 
 
741 aa  630  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  41.01 
 
 
751 aa  594  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3418  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  43.53 
 
 
738 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1409  dipeptidyl-peptidase IV  40.7 
 
 
754 aa  521  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  36.58 
 
 
812 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  33.51 
 
 
771 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  37.33 
 
 
733 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  34.41 
 
 
723 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0056  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  31.59 
 
 
747 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.96 
 
 
739 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  32.64 
 
 
721 aa  351  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  33.86 
 
 
732 aa  337  7e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  34.24 
 
 
568 aa  322  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1057  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.38 
 
 
737 aa  318  3e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0728154  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0503  dipeptidyl aminopeptidase IV  31.02 
 
 
723 aa  315  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1194  Dipeptidyl-peptidase IV  31.5 
 
 
757 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.929099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.65 
 
 
724 aa  315  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.26 
 
 
721 aa  310  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.94 
 
 
709 aa  310  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2431  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.24 
 
 
735 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474543  normal  0.175702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2523  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.74 
 
 
740 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2619  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.88 
 
 
735 aa  295  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0220862  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2538  Dipeptidyl-peptidase IV  31.05 
 
 
1006 aa  292  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2549  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.8 
 
 
725 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1335  peptidase S9, dipeptidylpeptidase  30.93 
 
 
749 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1085  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.47 
 
 
718 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.968267  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0755  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.17 
 
 
719 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5657  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.62 
 
 
693 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.56481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3037  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain-containing protein  31.1 
 
 
685 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4028  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30 
 
 
732 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3909  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.45 
 
 
732 aa  250  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23950  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.67 
 
 
711 aa  249  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111668  normal  0.0730472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8451  peptidase, S9B (dipeptidyl peptidase IV) subfamily  29.84 
 
 
689 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.695642  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3655  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.69 
 
 
726 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0640869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5287  Dipeptidyl-peptidase IV  28.45 
 
 
683 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06438  hypothetical dipeptidyl aminopeptidase (Eurofung)  28.91 
 
 
773 aa  239  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0485  putative peptidase  30.14 
 
 
711 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1253  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain-containing protein  27.56 
 
 
714 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02946  Dipeptidyl aminopeptidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI80]  30.08 
 
 
906 aa  211  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.53 
 
 
692 aa  210  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3764  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.53 
 
 
710 aa  207  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01410  dipeptidyl-peptidase and tripeptidyl-peptidase, putative  27.89 
 
 
883 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2692  Dipeptidyl-peptidase IV  27.99 
 
 
772 aa  203  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00660849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4146  dipeptidyl-peptidase IV  26.9 
 
 
714 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04186  dipeptidyl peptidase IV  29.13 
 
 
770 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.804182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.9 
 
 
828 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0576  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.54 
 
 
828 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.115519  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.44 
 
 
688 aa  188  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84390  dipeptidyl aminopeptidase B  26.56 
 
 
852 aa  187  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309155  normal  0.832688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.59 
 
 
831 aa  188  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01445  peptidase  27.95 
 
 
779 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3912  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.36 
 
 
701 aa  184  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.86 
 
 
827 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 
829 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0346  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  24.58 
 
 
764 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.8 
 
 
827 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  28.36 
 
 
795 aa  181  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0013  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28 
 
 
795 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  28.51 
 
 
826 aa  179  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.14 
 
 
826 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1376  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.91 
 
 
814 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.08 
 
 
826 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000738695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.08 
 
 
826 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000363184  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.17 
 
 
800 aa  174  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.08 
 
 
826 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.82 
 
 
826 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  27.63 
 
 
824 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.82 
 
 
826 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.47 
 
 
826 aa  172  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03743  dipeptidyl peptidase  26.93 
 
 
786 aa  171  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1436  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.21 
 
 
776 aa  170  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  0.0231661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1624  dipeptidyl-peptidase IV  39.21 
 
 
228 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.88 
 
 
823 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.64 
 
 
789 aa  168  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02195  Dipeptidyl peptidase IV  26.8 
 
 
831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3167  putative peptidase  26.09 
 
 
819 aa  160  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3325  Dipeptidyl-peptidase IV  26.22 
 
 
710 aa  160  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2525  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.38 
 
 
850 aa  160  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01460  peptidase  25.04 
 
 
756 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3030  Dipeptidyl-peptidase IV  27.17 
 
 
783 aa  152  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>