21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  54.25 
 
 
154 aa  186  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  35.14 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  36.67 
 
 
153 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  34.69 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  29.73 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  33.05 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  34.19 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  32.79 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  29.31 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  26.5 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  26.52 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  28.81 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  29.66 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  29.06 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  26.09 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  23.73 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24240  hypothetical protein  20.41 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  23.93 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  28.21 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>