32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  100 
 
 
533 aa  1058    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  31.75 
 
 
522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  30.8 
 
 
522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  29.43 
 
 
539 aa  117  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  36.36 
 
 
482 aa  92.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  27.2 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  30.36 
 
 
480 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.28 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  27.21 
 
 
540 aa  65.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24340  putative collagen-binding protein  30 
 
 
845 aa  60.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  27.18 
 
 
920 aa  57  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  29.84 
 
 
634 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1524  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.88 
 
 
639 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0829839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  26.82 
 
 
2272 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25 
 
 
553 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  34.65 
 
 
3242 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  29.39 
 
 
508 aa  49.3  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1407  cell wall surface anchor family protein  28.05 
 
 
705 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  25 
 
 
2136 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  26.44 
 
 
2179 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.56 
 
 
971 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  36.56 
 
 
969 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  36.56 
 
 
969 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1523  hypothetical protein  25.56 
 
 
660 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31.58 
 
 
3190 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  27.5 
 
 
3392 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  35.78 
 
 
1112 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  35.78 
 
 
1328 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.7 
 
 
3210 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  27.43 
 
 
725 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  27.85 
 
 
3333 aa  43.5  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  36.56 
 
 
1508 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>