28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3119 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  332  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0995943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  29.29 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  29.66 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  26.75 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  26.54 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1222  protein of unknown function, Spy-related  28.85 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0499596  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  26.88 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3920  lipoprotein signal peptide  33.04 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  44.3  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  36.29 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3542  hypothetical protein  25.53 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  29.85 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  37.27 
 
 		 184 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  37.27 
 
 		 184 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  37.27 
 
 		 184 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  26.56 
 
 		 160 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  31.4 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  31.4 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  31.4 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  31.4 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  24.18 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  31.4 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  29.41 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  31.4 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  30.51 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  23.97 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>