11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3542 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  354  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0953  hypothetical protein  26.39 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  0.902908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3915  integral membrane protein  22.96 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0414  hypothetical protein  28.92 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.745309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2070  hypothetical protein  28.92 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3891  integral membrane protein  21.48 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4477  integral membrane protein  21.48 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5826  integral membrane protein  21.48 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1381  integral membrane protein  24.26 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276174  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4379  integral membrane protein  21.48 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4088  putative membrane-associated protein  26 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>