15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3915 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3915  integral membrane protein  100 
 
 		 167 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4379  integral membrane protein  94.58 
 
 		 165 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3891  integral membrane protein  88.12 
 
 		 167 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4477  integral membrane protein  88.12 
 
 		 167 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5826  integral membrane protein  88.12 
 
 		 167 aa  284  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1381  integral membrane protein  87.65 
 
 		 167 aa  283  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276174  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4088  putative membrane-associated protein  60.65 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5023  putative membrane-associated protein  59.35 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.651837  normal  0.0723154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3441  putative membrane-associated protein  51.95 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1627  putative membrane-associated protein  57.14 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130979  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4215  putative membrane-associated protein  43.21 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5241  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3542  hypothetical protein  22.96 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2338  integral membrane protein-like protein  34.21 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0949  integral membrane protein  33.8 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>