16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5023 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5023  putative membrane-associated protein  100 
 
 		 172 aa  337  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.651837  normal  0.0723154 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1627  putative membrane-associated protein  86.63 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130979  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4088  putative membrane-associated protein  67.11 
 
 		 175 aa  197  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3441  putative membrane-associated protein  61.15 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5826  integral membrane protein  58.93 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3891  integral membrane protein  58.33 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4477  integral membrane protein  58.33 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1381  integral membrane protein  57.31 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276174  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4379  integral membrane protein  60.65 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3915  integral membrane protein  59.35 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4215  putative membrane-associated protein  47.68 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5241  hypothetical protein  34.19 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2070  hypothetical protein  32.86 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0414  hypothetical protein  32.86 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.745309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2338  hypothetical protein  30.71 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0109598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2338  integral membrane protein-like protein  29.31 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>