15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5826 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5826  integral membrane protein  100 
 
 
167 aa  330  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3891  integral membrane protein  98.8 
 
 
167 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4477  integral membrane protein  98.8 
 
 
167 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786434  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1381  integral membrane protein  88.02 
 
 
167 aa  293  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276174  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3915  integral membrane protein  88.12 
 
 
167 aa  284  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4379  integral membrane protein  87.5 
 
 
165 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4088  putative membrane-associated protein  60.65 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5023  putative membrane-associated protein  58.93 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.651837  normal  0.0723154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3441  putative membrane-associated protein  52.9 
 
 
167 aa  150  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1627  putative membrane-associated protein  60.9 
 
 
172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130979  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4215  putative membrane-associated protein  43.71 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0405872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5241  hypothetical protein  35.86 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3542  hypothetical protein  21.48 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382158  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0949  integral membrane protein  32.39 
 
 
177 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2338  integral membrane protein-like protein  32.32 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>