14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4088 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4088  putative membrane-associated protein  100 
 
 		 175 aa  346  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5023  putative membrane-associated protein  64.24 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.651837  normal  0.0723154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1381  integral membrane protein  62.58 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276174  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3891  integral membrane protein  61.29 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4477  integral membrane protein  61.29 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5826  integral membrane protein  60.65 
 
 		 167 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3915  integral membrane protein  60.65 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4379  integral membrane protein  60 
 
 		 165 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3441  putative membrane-associated protein  57.59 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1627  putative membrane-associated protein  68.66 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130979  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4215  putative membrane-associated protein  45.78 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5241  hypothetical protein  39.04 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2338  integral membrane protein-like protein  29.33 
 
 		 179 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3542  hypothetical protein  25.9 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>