15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1381 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1381  integral membrane protein  100 
 
 
167 aa  329  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276174  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3891  integral membrane protein  89.22 
 
 
167 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4477  integral membrane protein  89.22 
 
 
167 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786434  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5826  integral membrane protein  88.02 
 
 
167 aa  293  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22566  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3915  integral membrane protein  87.65 
 
 
167 aa  283  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4379  integral membrane protein  87.5 
 
 
165 aa  280  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4088  putative membrane-associated protein  62.58 
 
 
175 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5023  putative membrane-associated protein  57.31 
 
 
172 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.651837  normal  0.0723154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3441  putative membrane-associated protein  52.26 
 
 
167 aa  147  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1627  putative membrane-associated protein  58.52 
 
 
172 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130979  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4215  putative membrane-associated protein  44.37 
 
 
187 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0405872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5241  hypothetical protein  36.55 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0949  integral membrane protein  32.88 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2338  integral membrane protein-like protein  31.52 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3542  hypothetical protein  24.26 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>