20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2002 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2002  amidohydrolase 2  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0199491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  32.88 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27.22 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  38.89 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  27.44 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  36.73 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.51 
 
 		 279 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  32.56 
 
 		 364 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  27.33 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  39.34 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  35.9 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.97 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  39.29 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.33 
 
 		 383 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  22.31 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.14 
 
 		 339 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  27.94 
 
 		 244 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>