32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1423 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 418 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  27.45 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  35.25 
 
 		 417 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  27.2 
 
 		 560 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1439  MJ0042 family finger-like protein  28.29 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  35.78 
 
 		 635 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1544  Zinc finger-domain-containing protein  28.19 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  30.59 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  30.97 
 
 		 547 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  32.81 
 
 		 707 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  32.81 
 
 		 694 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0472  hypothetical protein  27.51 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0337887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2111  hypothetical protein  25.49 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0575068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  28.7 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  23.42 
 
 		 383 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  35.37 
 
 		 1144 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  35.37 
 
 		 1163 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  32.69 
 
 		 318 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  35.56 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  33.33 
 
 		 1244 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  43.9 
 
 		 530 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  43.9 
 
 		 532 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  44.9 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  45.24 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0976  Zinc finger-domain-containing protein  48.65 
 
 		 588 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  37.04 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  48.57 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  38.64 
 
 		 538 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  37.21 
 
 		 1139 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>