18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1544 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1544  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0472  hypothetical protein  51.08 
 
 		 322 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0337887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2111  hypothetical protein  50.38 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0575068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1439  MJ0042 family finger-like protein  44.62 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  40.67 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  50.39 
 
 		 383 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  34.41 
 
 		 560 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  29.51 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  30 
 
 		 418 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  26.94 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  25.87 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  33.61 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  33.61 
 
 		 694 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  25.84 
 
 		 501 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  27.57 
 
 		 547 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  26.5 
 
 		 635 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3085  Zinc finger-domain-containing protein  37.31 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  48.57 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>