18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1439 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1439  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2111  hypothetical protein  44.66 
 
 		 256 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0575068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1544  Zinc finger-domain-containing protein  44.62 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0472  hypothetical protein  52.66 
 
 		 322 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0337887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  38.91 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  46.22 
 
 		 383 aa  124  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  27.09 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  31.15 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  26.88 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  32.77 
 
 		 707 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  32.77 
 
 		 694 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  23.53 
 
 		 547 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  24.08 
 
 		 418 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  26.63 
 
 		 547 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  22.02 
 
 		 501 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  21.95 
 
 		 635 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  41.18 
 
 		 1244 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  34.62 
 
 		 306 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>