More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0062 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 312 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  53.64 
 
 		 303 aa  358  8e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 303 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 		 305 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 303 aa  345  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 		 321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 309 aa  331  7.000000000000001e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 303 aa  330  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  53.64 
 
 		 298 aa  328  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 		 314 aa  328  9e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 312 aa  325  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 306 aa  322  6e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.34 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 315 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  52.61 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  53.64 
 
 		 304 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  51.68 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 312 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  53.25 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 355 aa  311  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  51.29 
 
 		 304 aa  311  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 302 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 		 312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 312 aa  308  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  50.96 
 
 		 313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 		 312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 300 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 		 304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 305 aa  305  7e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  54.58 
 
 		 309 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  54.58 
 
 		 309 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 304 aa  301  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 318 aa  301  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 313 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 		 303 aa  299  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 		 316 aa  298  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  53.59 
 
 		 309 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 303 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 		 317 aa  298  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 		 316 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 		 308 aa  295  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  52.04 
 
 		 318 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>