103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3488 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1519  Ankyrin  30.85 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  31.28 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  28.64 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  28.77 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  37.37 
 
 		 533 aa  72.8  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1521  hypothetical protein  27.68 
 
 		 355 aa  72  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  26.09 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4263  Ankyrin  26.17 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4265  Ankyrin  27.96 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3680  ankyrin  27.64 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0048166  normal  0.286035 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1585 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4266  Ankyrin  31.45 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4078  Ankyrin  27.92 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  27.1 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6088  ankyrin  30.27 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2435  putative lipoprotein  27.71 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.987878  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  28.08 
 
 		 870 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2436  Ankyrin  27.47 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.274512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2413 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  26.29 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  31.14 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  27.98 
 
 		 1061 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  30.43 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1005 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  25.37 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  26.47 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0687  hypothetical protein  25.68 
 
 		 902 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0934  ankyrin  26.54 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.793859 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 1977 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  24.3 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  28.18 
 
 		 954 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  26.74 
 
 		 711 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 1021 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  25.62 
 
 		 404 aa  52.8  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  28.85 
 
 		 933 aa  52.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  28.74 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  27.22 
 
 		 723 aa  52.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  23.56 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1215  Ankyrin  24.86 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  24.16 
 
 		 345 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  26.99 
 
 		 855 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03267  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 		 766 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  27.43 
 
 		 578 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  27.96 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  27.88 
 
 		 715 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2481  Ankyrin  24.54 
 
 		 391 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000229526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  29.35 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  32.1 
 
 		 490 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  28.57 
 
 		 756 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  26.74 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0750  hypothetical protein  26.89 
 
 		 945 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0732  hypothetical protein  27.62 
 
 		 945 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1249 aa  48.9  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  28.09 
 
 		 574 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  27.51 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  23.86 
 
 		 821 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  25.15 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  25.67 
 
 		 1133 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  25.95 
 
 		 469 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1125  ankyrin repeat-containing protein  22.38 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  25.48 
 
 		 1099 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  25.48 
 
 		 1101 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  25.6 
 
 		 731 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 1622 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  25.37 
 
 		 479 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  27.53 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41686  VIC family transporter: inwardly rectifying potassium ion channel  30.32 
 
 		 648 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0173475  decreased coverage  0.000449346 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  26.87 
 
 		 2171 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  27.88 
 
 		 545 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2701  Ankyrin  21.12 
 
 		 385 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.575669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3599  ankyrin repeat-containing protein  22.38 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1177  ankyrin  22.38 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  23.83 
 
 		 423 aa  46.6  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  23.36 
 
 		 382 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  30.09 
 
 		 556 aa  45.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  27.94 
 
 		 1097 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3286  Ankyrin  29.6 
 
 		 708 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 		 1198 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  25.14 
 
 		 541 aa  44.3  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  26.01 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  26.9 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  27.38 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  26.76 
 
 		 426 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  26.45 
 
 		 170 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0003  ankyrin repeat-containing protein  25.3 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1452  predicted protein  25.93 
 
 		 493 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0338335  normal  0.137357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1667  Ankyrin  26.7 
 
 		 509 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0978  ankyrin repeat-containing protein  24.65 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.90033  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  26.43 
 
 		 750 aa  43.5  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  20.67 
 
 		 583 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  31.96 
 
 		 395 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0662  ankyrin  25.62 
 
 		 358 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00179604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  23.42 
 
 		 4520 aa  43.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  28.48 
 
 		 368 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  21.21 
 
 		 640 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1453  TPR domain-containing protein  23.16 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157912  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  24.4 
 
 		 646 aa  42.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  25.9 
 
 		 208 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3036  Ankyrin  21.62 
 
 		 276 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>