22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3036 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3036  Ankyrin  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1214  Ankyrin  85.51 
 
 		 276 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1215  Ankyrin  64.13 
 
 		 276 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4078  Ankyrin  52.19 
 
 		 270 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  26.92 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  25.1 
 
 		 259 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  23.14 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  24.51 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4263  Ankyrin  23.53 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  25.79 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4265  Ankyrin  23.64 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4266  Ankyrin  24.32 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  23.79 
 
 		 530 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6088  ankyrin  23.68 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  24.16 
 
 		 715 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2435  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.987878  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1585 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  21.33 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  26.88 
 
 		 2171 aa  42.7  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03541  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 568 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000863572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  29.73 
 
 		 533 aa  42.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3488  hypothetical protein  21.62 
 
 		 261 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>