22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1214 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1214  Ankyrin  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3036  Ankyrin  85.51 
 
 		 276 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1215  Ankyrin  71.21 
 
 		 276 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4078  Ankyrin  50.2 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  29.82 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  27.69 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  29.2 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  26.22 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  25.78 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4263  Ankyrin  25.1 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4265  Ankyrin  25.79 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4266  Ankyrin  27.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  25.22 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  26.34 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  28.71 
 
 		 2171 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  23.38 
 
 		 530 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6088  ankyrin  23.28 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2435  putative lipoprotein  23.85 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.987878  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03541  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 		 568 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000863572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  23.6 
 
 		 715 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1585 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  26.63 
 
 		 870 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>