43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2436 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2436  Ankyrin  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.274512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2435  putative lipoprotein  47.27 
 
 
247 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.987878  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6088  ankyrin  37.18 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239152  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  26.91 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  26.91 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  23.79 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4263  Ankyrin  27.88 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  25.3 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4265  Ankyrin  25.83 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  26.34 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0819  Ankyrin  31.61 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00484639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3488  hypothetical protein  27.47 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  24.89 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4266  Ankyrin  25.7 
 
 
232 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.67 
 
 
731 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  25 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  28.82 
 
 
1585 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  32.89 
 
 
715 aa  53.1  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  27.56 
 
 
321 aa  52.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  25 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  30.36 
 
 
395 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  29.05 
 
 
556 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  36.27 
 
 
479 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  35.11 
 
 
509 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  31.47 
 
 
1156 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  27.49 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.92 
 
 
2413 aa  46.2  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  38.89 
 
 
581 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0934  ankyrin  27.33 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.793859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  27.86 
 
 
155 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  33.78 
 
 
933 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  38.67 
 
 
590 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  25.67 
 
 
1402 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  25.71 
 
 
756 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  29.17 
 
 
426 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0830  hypothetical protein  25.73 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0248874 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  25.45 
 
 
483 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  24.47 
 
 
305 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3680  ankyrin  25.7 
 
 
251 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0048166  normal  0.286035 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 
307 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  30.3 
 
 
445 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5149  ankyrin  27.65 
 
 
589 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377523  normal  0.510979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  27.27 
 
 
1061 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>