14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1521 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1521  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  739    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1519  Ankyrin  79.15 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3488  hypothetical protein  27.68 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  26.79 
 
 
259 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3680  ankyrin  29.11 
 
 
251 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0048166  normal  0.286035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  24.63 
 
 
254 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  40.48 
 
 
533 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  24.81 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  40.48 
 
 
530 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  26.86 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  28.28 
 
 
870 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  26.97 
 
 
1061 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08580  ankyrin repeat-containing protein  34.46 
 
 
258 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  hitchhiker  0.0000415103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0934  ankyrin  27.78 
 
 
223 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.793859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>