42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0003 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0003  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2014  ankyrin repeat-containing protein  42.51 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66402  Myosin class V heavy chain  35.29 
 
 
812 aa  59.7  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00220738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  31.33 
 
 
533 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  31.9 
 
 
870 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  30.72 
 
 
217 aa  56.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18840  ankyrin repeat-containing protein  36.75 
 
 
467 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.065802 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  32.39 
 
 
2171 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  30.49 
 
 
530 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  29.03 
 
 
217 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09003  conserved hypothetical protein  34.68 
 
 
1387 aa  52.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  32.2 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  33.58 
 
 
954 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.47 
 
 
762 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1848  ankyrin  31.47 
 
 
495 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08580  ankyrin repeat-containing protein  26.87 
 
 
258 aa  49.7  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  hitchhiker  0.0000415103 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  31.06 
 
 
790 aa  49.7  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3680  ankyrin  28.28 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0048166  normal  0.286035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  33.07 
 
 
445 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0073  ankyrin repeat-containing protein  30.28 
 
 
800 aa  48.9  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  31.31 
 
 
715 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  30.52 
 
 
382 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19610  ankyrin repeat-containing protein  30.53 
 
 
353 aa  45.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  30.52 
 
 
756 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02195  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 
1800 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  36.63 
 
 
490 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  32.45 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  29.23 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  31.94 
 
 
541 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  25.84 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  30.77 
 
 
426 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.92 
 
 
731 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.36 
 
 
427 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32.84 
 
 
1585 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3488  hypothetical protein  25.3 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  35.44 
 
 
208 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08550  ankyrin repeat-containing protein  25.14 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  31.06 
 
 
214 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  30.06 
 
 
423 aa  42.7  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2098  Ankyrin  26.32 
 
 
244 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  34.75 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1999  ankyrin repeat-containing protein  38.67 
 
 
512 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.224221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>