38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2992 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  49.04 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  50 
 
 		 607 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  55.37 
 
 		 824 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  65 
 
 		 402 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  59.48 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  51.49 
 
 		 454 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  66.32 
 
 		 804 aa  131  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  61.86 
 
 		 464 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  50.35 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  55.14 
 
 		 546 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  56.57 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  56.12 
 
 		 545 aa  111  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  42.14 
 
 		 534 aa  91.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  40.29 
 
 		 1217 aa  89  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  46.15 
 
 		 643 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  44.76 
 
 		 1309 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.66 
 
 		 913 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1137 aa  78.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  41.6 
 
 		 922 aa  78.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1219 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  42.45 
 
 		 935 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  38.14 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  33.65 
 
 		 909 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  36.54 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  40.24 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  37.18 
 
 		 595 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  33.06 
 
 		 723 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  34.48 
 
 		 409 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  31.78 
 
 		 456 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1627 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  31.19 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  37.86 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  35.35 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  29.94 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1058 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  37.25 
 
 		 243 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  31.73 
 
 		 896 aa  41.2  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>