21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1584 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  34.44 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  33.82 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  38.03 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  40 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  32.89 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  31.17 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0860  hypothetical protein  29.87 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.72 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  35.94 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  31.17 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.87 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2587  glutaredoxin  35.21 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  31.17 
 
 		 383 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  32.43 
 
 		 384 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  25.71 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  25.33 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  35.82 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  30.16 
 
 		 398 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.88 
 
 		 81 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>