39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2114 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  55.26 
 
 		 304 aa  359  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  38.31 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  29.41 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  25.61 
 
 		 463 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  28.02 
 
 		 261 aa  86.7  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  25.35 
 
 		 460 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  26.86 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  27.95 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  26.17 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  25.84 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  21.51 
 
 		 469 aa  75.9  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  26.43 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  23.69 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  23.74 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  23.48 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  25.44 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  31.01 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  23.08 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  24.82 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  24.14 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  20.88 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.34 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  23.4 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  23.83 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  24.84 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  20.45 
 
 		 464 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  25.7 
 
 		 450 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  24.22 
 
 		 463 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  26.06 
 
 		 431 aa  53.1  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  24.57 
 
 		 471 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  24.86 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  23.01 
 
 		 462 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  23.49 
 
 		 472 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  25.41 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  28 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  22.5 
 
 		 469 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  26.59 
 
 		 456 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  28 
 
 		 475 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>