18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0784 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  56 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  50.7 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  31.78 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  44.3 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  34.12 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2034  hypothetical protein  42.31 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000850419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  35.48 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  29.23 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0619  hypothetical protein  41.89 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  28.81 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  32.08 
 
 		 135 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  28.38 
 
 		 160 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  27.4 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>