More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2185 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 		 458 aa  926    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  64.32 
 
 		 451 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  64.32 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  62.1 
 
 		 443 aa  566  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  63.72 
 
 		 452 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  61.57 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  63.57 
 
 		 452 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  63.78 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  62.9 
 
 		 452 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  63.27 
 
 		 451 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  63.27 
 
 		 451 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  63.27 
 
 		 451 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  64.86 
 
 		 452 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  62.03 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  60.04 
 
 		 458 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  61.79 
 
 		 439 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  61.47 
 
 		 470 aa  522  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  58.97 
 
 		 552 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  62.56 
 
 		 446 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  61.63 
 
 		 446 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  61.18 
 
 		 446 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  61.3 
 
 		 480 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  64.01 
 
 		 460 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  62.77 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  58.97 
 
 		 549 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  61.15 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  61.15 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  58.16 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  59.86 
 
 		 459 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  58.97 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  61.15 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  58.96 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  61.87 
 
 		 444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  60.92 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  60.92 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  61.15 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  60.92 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  60.92 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  61.02 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  59.17 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  59.81 
 
 		 524 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  61.41 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  60.99 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  59.44 
 
 		 513 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  58.37 
 
 		 513 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  60.19 
 
 		 439 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  59.5 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  59.5 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  59.5 
 
 		 481 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3278  flagellum-specific ATP synthase FliI  58.72 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  58.72 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  58.72 
 
 		 526 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  58.72 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  58.72 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  61.03 
 
 		 446 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  58.72 
 
 		 513 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  60.85 
 
 		 446 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  58.72 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  58.72 
 
 		 513 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  58.72 
 
 		 514 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2943  flagellum-specific ATP synthase FliI  58.72 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  59.73 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  59.16 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  57.92 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  59.57 
 
 		 519 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  61.54 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  59.63 
 
 		 478 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  58.37 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  60.28 
 
 		 454 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  62.28 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  58.92 
 
 		 456 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  60.34 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  58.37 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1161  flagellar protein export ATPase FliI  58.47 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489016  normal  0.0133257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  58.92 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  60 
 
 		 465 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  60.77 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1091  flagella ATPase FliI  58.54 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  59.59 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  59.16 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  59.16 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  59.16 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  59.16 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  59.16 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1958  ATPase FliI/YscN  59.67 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  58.99 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  56.57 
 
 		 456 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  58.62 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  57.41 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  57.74 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  58.88 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1573  flagellum-specific ATP synthase  60.14 
 
 		 456 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  58.07 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  56.45 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  55.94 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  56.53 
 
 		 438 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  53.66 
 
 		 466 aa  471  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  55.11 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  57.59 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0495  flagellar protein export ATPase FliI  61.45 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>