283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0217 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  100 
 
 
293 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  97.95 
 
 
293 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  97.61 
 
 
293 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  96.25 
 
 
293 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  85.71 
 
 
289 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  79.86 
 
 
290 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  79.86 
 
 
290 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  78.87 
 
 
289 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  77.78 
 
 
290 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  67.49 
 
 
304 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  39.93 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  39.93 
 
 
284 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  39.22 
 
 
284 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  39.22 
 
 
284 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  39.22 
 
 
284 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  39.22 
 
 
284 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  39.22 
 
 
284 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  37.81 
 
 
283 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  39.22 
 
 
284 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  39.22 
 
 
284 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  39.22 
 
 
284 aa  225  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  37.1 
 
 
283 aa  225  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  37.1 
 
 
283 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  38.87 
 
 
284 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  37.1 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  37.1 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  37.1 
 
 
283 aa  221  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  37.1 
 
 
283 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  40.28 
 
 
282 aa  219  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  38.87 
 
 
281 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  39.29 
 
 
296 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  35.34 
 
 
283 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  36.86 
 
 
289 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  35.46 
 
 
283 aa  189  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  35.42 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  35.34 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  35.34 
 
 
279 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  36.27 
 
 
290 aa  175  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  33.92 
 
 
284 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  32.86 
 
 
282 aa  169  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  33.19 
 
 
240 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  35.61 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  32.5 
 
 
303 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  30.88 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  28.42 
 
 
285 aa  145  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.93 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  28.99 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  30.5 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  28.93 
 
 
305 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  31.09 
 
 
287 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  27.56 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  28.06 
 
 
290 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  30.69 
 
 
293 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  27.74 
 
 
290 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  31.77 
 
 
295 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  27.36 
 
 
638 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  29.91 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  29.33 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  26.95 
 
 
357 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  26.87 
 
 
422 aa  92  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  26.95 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  26.95 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  26.95 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  27.55 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  26.6 
 
 
357 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  26.6 
 
 
357 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  26.6 
 
 
357 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  26.55 
 
 
356 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  26.6 
 
 
357 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  32.84 
 
 
378 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  28.08 
 
 
364 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  28.08 
 
 
357 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  26.53 
 
 
424 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  28.08 
 
 
364 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  27.74 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  26.6 
 
 
357 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  26.53 
 
 
422 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  27.74 
 
 
364 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  26.3 
 
 
343 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  26.9 
 
 
335 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  25.52 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  29.22 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  27.51 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  27.51 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  28.51 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  27.04 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  26.92 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.75 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  23.89 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  29.1 
 
 
389 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  29.21 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  27.84 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.47 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  24.55 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  26.15 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  26.64 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.09 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  25.67 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  27.72 
 
 
358 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  28.88 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>